29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0408 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0408  transposase  100 
 
 		 100 aa  212  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  96.72 
 
 		 323 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  95.08 
 
 		 238 aa  130  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 323 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  90.16 
 
 		 323 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  85.25 
 
 		 323 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00517  transposase  73.91 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 463 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4133  transposase  63.77 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261032  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  59.02 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 333 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  58.33 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2834  hypothetical protein  85.11 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  54.84 
 
 		 441 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  56.67 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  53.97 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  55 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  55 
 
 		 329 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  55.93 
 
 		 327 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  55.93 
 
 		 333 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  53.33 
 
 		 325 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  54.24 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  54.24 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  54.39 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0469  hypothetical protein  84.62 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  61.22 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  40.68 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  41.86 
 
 		 291 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  41.86 
 
 		 291 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>