17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0253 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  100 
 
 		 336 aa  680    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2698  TadE family protein  44 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2111  TadE family protein  34.68 
 
 		 237 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2304  TadE family protein  38.51 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  34.68 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2294  TadE family protein  39.2 
 
 		 280 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4350  TadE family protein  33.89 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2301  hypothetical protein  37.95 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6880  TadE family protein  33.91 
 
 		 278 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  normal  0.128629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0713  hypothetical protein  31.02 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0639  hypothetical protein  29.55 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0743  hypothetical protein  27.42 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  41.67 
 
 		 122 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  49.02 
 
 		 138 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  37.5 
 
 		 134 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0252  hypothetical protein  36.9 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.035265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  34.85 
 
 		 137 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>