More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5431 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  66.01 
 
 		 205 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  51.96 
 
 		 203 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  50.73 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0484  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.02 
 
 		 205 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 		 209 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0332  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.08 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  38.46 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  36.54 
 
 		 201 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  38.46 
 
 		 201 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  38.46 
 
 		 201 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  38.46 
 
 		 201 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  38.46 
 
 		 201 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  38.46 
 
 		 201 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  38.46 
 
 		 201 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  38.46 
 
 		 201 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  38.46 
 
 		 201 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0549  glutathione S-transferase-like protein  49.19 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  36.32 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  37.98 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  36.36 
 
 		 204 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  36.67 
 
 		 217 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.56 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  36.49 
 
 		 218 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  37.07 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  37.07 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  37.07 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  37.07 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  36.59 
 
 		 201 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  37.07 
 
 		 203 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  35.12 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  36.36 
 
 		 204 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  34.15 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  34.15 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  34.93 
 
 		 201 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  33.98 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 		 202 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  34.15 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  33.98 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  33.98 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  37.32 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  34.63 
 
 		 201 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  34.93 
 
 		 204 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.15 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  33.66 
 
 		 204 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 204 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  34.15 
 
 		 202 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.07 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  34.62 
 
 		 201 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.36 
 
 		 214 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  31.98 
 
 		 211 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  35.12 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  36.36 
 
 		 214 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  29.74 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  35.68 
 
 		 202 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  33.66 
 
 		 204 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  33.97 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.76 
 
 		 215 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  35.64 
 
 		 203 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.8 
 
 		 210 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.2 
 
 		 205 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  33.01 
 
 		 202 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  32.54 
 
 		 203 aa  99  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  34.15 
 
 		 201 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  35.75 
 
 		 206 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  33.01 
 
 		 202 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  33 
 
 		 196 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  37.57 
 
 		 215 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  38.32 
 
 		 206 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  33.9 
 
 		 220 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  33.82 
 
 		 205 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.29 
 
 		 214 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  32.37 
 
 		 202 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 201 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.61 
 
 		 206 aa  92.4  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  34.45 
 
 		 201 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 		 227 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3179  Glutathione S-transferase domain protein  29.9 
 
 		 209 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  34.45 
 
 		 201 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  30.39 
 
 		 209 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 		 206 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 		 201 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  31.88 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 		 202 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  31.4 
 
 		 201 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  31.86 
 
 		 205 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  35.07 
 
 		 198 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0958  Glutathione S-transferase domain protein  33.04 
 
 		 227 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  31.43 
 
 		 212 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.97 
 
 		 217 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2997  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.11 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0721  glutathione S-transferase  31.66 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.195478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  31.48 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6303  glutathione S-transferase-like protein  32.46 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4046  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.15 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.862482  normal  0.281853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>