18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3538 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  527  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0962  hypothetical protein  47.72 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3877  hypothetical protein  47.72 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.937097  normal  0.0365098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0906  hypothetical protein  47.72 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00191  hypothetical protein  38.02 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.398851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00192  predicted lipoprotein  38.02 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0197  hypothetical protein  39.13 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3466  hypothetical protein  39.13 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310115  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0187  hypothetical protein  39.13 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.656358  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3409  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.280646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0204  hypothetical protein  37.04 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0504389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0205  hypothetical protein  36.21 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0381  hypothetical protein  28.66 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000232223  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6529  hypothetical protein  28.5 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  28.19 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1919  hypothetical protein  27.67 
 
 		 154 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.795239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0049  hypothetical protein  26.98 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0160  hypothetical protein  27.54 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>