18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0381 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0381  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  385  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000232223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1093  hypothetical protein  26.11 
 
 
523 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000429032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3370  hypothetical protein  26.92 
 
 
488 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3132  hypothetical protein  26.88 
 
 
256 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  28.66 
 
 
263 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3877  hypothetical protein  23.15 
 
 
285 aa  48.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.937097  normal  0.0365098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0962  hypothetical protein  23.15 
 
 
285 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0906  hypothetical protein  23.15 
 
 
285 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0084  hypothetical protein  24.17 
 
 
498 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00246514  hitchhiker  0.000370561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  32.94 
 
 
319 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  33.33 
 
 
217 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0390  hypothetical protein  29.01 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1217  cell wall-associated hydrolase-like protein  28.24 
 
 
263 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42 
 
 
452 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
327 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3182  hypothetical protein  25.17 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44 
 
 
438 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  36.14 
 
 
348 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>