33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000058 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  90.74 
 
 
271 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0692  lipase, class 3  79.63 
 
 
276 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  50.47 
 
 
262 aa  229  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  47.44 
 
 
261 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  28.29 
 
 
448 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  33.33 
 
 
324 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  40 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  29.27 
 
 
277 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  25.13 
 
 
294 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  26.29 
 
 
299 aa  48.9  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  26.45 
 
 
258 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  29.75 
 
 
384 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  21.58 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  21.66 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  20.63 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  21.66 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  21.05 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  21.05 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  21.05 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  21.05 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  30.08 
 
 
381 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  27.44 
 
 
387 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  27.44 
 
 
387 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  30.25 
 
 
379 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  21.02 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  33 
 
 
539 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  20.38 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  25.29 
 
 
336 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  21.74 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92920  predicted protein  32.11 
 
 
507 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728823  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  32.46 
 
 
378 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  29.11 
 
 
276 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>