123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2292 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2292  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
89 aa  170  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11332  F0F1 ATP synthase subunit C  61.63 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1250  ATP synthase F0, C subunit  70.59 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1916  ATP synthase F0, C subunit  70.59 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4333  F0F1 ATP synthase subunit C  70.51 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424603  normal  0.0350807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2313  F0F1 ATP synthase subunit C  63.75 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3881  F0F1 ATP synthase subunit C  63.75 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3955  F0F1 ATP synthase subunit C  63.75 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0171157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3867  F0F1 ATP synthase subunit C  63.75 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.6502  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0648  F0F1 ATP synthase subunit C  56.41 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.157082 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  45.76 
 
 
70 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  39.74 
 
 
84 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  39.74 
 
 
84 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  37.35 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  38.24 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  52.63 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  52.63 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  52.63 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3310  F0F1 ATP synthase subunit C  42.42 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.48515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  31.71 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  40.91 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  32.1 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2874  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  32.91 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  32.91 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  46 
 
 
77 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  40.3 
 
 
79 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
82 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
82 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0007  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.316069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4109  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000110329  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  39.47 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  39.39 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  38.67 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  38.67 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4752  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4315  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0295154  hitchhiker  0.0000000000618272 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  30.38 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3757  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00912084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  43.86 
 
 
79 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3930  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0039435  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4022  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0586605  normal  0.864238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4050  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4135  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000070467  hitchhiker  0.00469633 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  36.36 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3649  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000588902  unclonable  0.00000652587 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  30.38 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  30.38 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4371  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000250209  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  30.38 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3850  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0401321  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4370  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00324113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4491  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000555437  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4512  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00265019  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4903  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000000864371  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3289  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.524691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000128569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5418  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.000148826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5604  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5126  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00154985  normal  0.574958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5735  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000209098  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73300  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.731054  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  36.67 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5300  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371709  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4467  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000500836  hitchhiker  0.00000000117641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6361  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5436  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5205  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158761  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>