21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2252 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  59.31 
 
 		 300 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  57.76 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  55.05 
 
 		 303 aa  299  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  53.43 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  53 
 
 		 319 aa  298  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  53.79 
 
 		 298 aa  291  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  43.87 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  42.64 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  41.28 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  38.76 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  36.8 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  37.64 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  37.64 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  33.46 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  32.95 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  30.34 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  30.3 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  32.46 
 
 		 444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  26.36 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>