87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0187 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0187  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
85 aa  161  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0069  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  72.94 
 
 
85 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0088  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  72.94 
 
 
85 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0079  phosphotransferase system, HPr  72.94 
 
 
85 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0753  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  70.59 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4853  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  69.41 
 
 
86 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0093  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.24 
 
 
85 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2216  phosphocarrier, HPr family  69.41 
 
 
86 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.081711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3185  HPr family phosphocarrier protein  62.35 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0997198  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16870  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  72.94 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.288242  normal  0.471923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28580  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  50.57 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00406387  normal  0.0448712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1050  phosphocarrier, HPr family  52.87 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0067  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.933007  normal  0.510342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07040  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  47.73 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4227  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.45 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1889  HPr family phosphocarrier protein  48.86 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0357203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15370  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  49.43 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363386  normal  0.66532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8115  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.13 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2174  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.32 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339455  hitchhiker  0.00100115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03520  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  42.53 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.58475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4007  HPr family phosphocarrier protein  45.65 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1539  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.19 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00351141  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2146  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.19 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0524  phosphocarrier, HPr family  42.68 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5267  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29360  Phosphocarrier protein HPr/PTS system IIA component  42.35 
 
 
231 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.521811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0298  HPr family phosphocarrier protein  45.16 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4845  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.69 
 
 
96 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.778236  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1429  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  40.91 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5261  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.31 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4027  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.06 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0620705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2214  HPr family phosphocarrier protein  49.12 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1769  phosphocarrier, HPr family protein  37.8 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0876  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.1 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.45631  normal  0.298141 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1325  phosphocarrier protein HPr  29.41 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000175669  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1269  phosphocarrier, HPr family  43.33 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.034972 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.5 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4180  phosphocarrier protein HPr  32.88 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3878  phosphocarrier protein HPr  34.25 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.050969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4116  phosphocarrier protein HPr  32.88 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  37.35 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1780  phosphocarrier protein HPr  42.59 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0365608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1641  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  26.58 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2748  phosphocarrier protein HPr  32.88 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7069  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.91 
 
 
691 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2487  phosphoryl transfer system, HPr  37.18 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.685989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  35.94 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4547  phosphocarrier protein NPr  34.12 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3959  phosphocarrier protein HPr  31.51 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.130103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3790  phosphocarrier protein HPr  31.51 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.190201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3805  phosphocarrier protein HPr  31.51 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241033  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1156  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  43.75 
 
 
237 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2036  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.52 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.67189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4268  phosphocarrier protein HPr  31.51 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2173  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.78 
 
 
835 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4158  phosphocarrier protein HPr  31.51 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00355795  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2878  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.68 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1080  phosphocarrier protein HPr  31.51 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4069  phosphocarrier protein HPr  31.51 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.486642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1951  phosphoryl transfer system HPr  40.62 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000513673 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.48 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0331  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.88 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  29.11 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2737  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.52 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0535175 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0974  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  45.71 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.806811  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0643  phosphocarrier protein HPr  34.62 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.958845  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.4 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1549  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.79 
 
 
86 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000108973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1735  HPrNtr domain-containing protein  34.18 
 
 
86 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0638  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  28.21 
 
 
86 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.866098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.72 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0150  phosphocarrier, HPr family  32.43 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
88 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  29.11 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1215  PTS system HPr component  38.46 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1769  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30.77 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30.95 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1818  phosphotransferase system, HPr  34.94 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0821  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.33 
 
 
956 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1651  phosphocarrier protein HPr  35.37 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  31.71 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5437  phosphocarrier, HPr family  43.24 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4267  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.5 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3201  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.18 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  30.59 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>