44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0062 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0062  SirA family protein  100 
 
 		 111 aa  230  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  35.21 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  30.14 
 
 		 201 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  35.21 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  31.94 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  33.33 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  33.33 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  33.8 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  29.33 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  35.94 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  34.21 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  34.21 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  34.21 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  30.67 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  30.14 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  33.85 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  30.26 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  31.51 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  30.3 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  31.51 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  30.65 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  31.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  26.39 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  26.39 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  26.39 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  26.39 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  35.14 
 
 		 77 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>