21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1672 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
442 aa  882  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 
431 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  33.11 
 
 
455 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  31.17 
 
 
444 aa  126  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  30.84 
 
 
444 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  30.45 
 
 
439 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  25.95 
 
 
545 aa  81.6  3e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  27.8 
 
 
339 aa  77.8  4e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  24.82 
 
 
518 aa  75.5  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  43.04 
 
 
414 aa  69.7  9e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  44.9 
 
 
411 aa  67.8  4e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  30.51 
 
 
320 aa  65.9  1e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3629  hypothetical protein  31.12 
 
 
320 aa  61.6  2e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.905259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  27.57 
 
 
556 aa  61.6  3e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  29.63 
 
 
429 aa  60.8  5e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  42.11 
 
 
418 aa  52.4  1e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  27.73 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  31.71 
 
 
400 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  27.97 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  29.17 
 
 
419 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>