18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1111 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  47.58 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  48.8 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  48.11 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  44.86 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  43.12 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  41.35 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  43.36 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  36.19 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  43.14 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  40.46 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  34.45 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  41.86 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  34.58 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  39.24 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1105  hypothetical protein  30.21 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0816974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>