16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4195 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  52.5 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  40.38 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  38.05 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  52.38 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  34.91 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  28.12 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  27.42 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  34.17 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  34.41 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  29.13 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  36.47 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  31.58 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>