18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2453 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  266  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  93.18 
 
 
132 aa  230  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  67.72 
 
 
135 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  56 
 
 
133 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  38.1 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  38.71 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  39.42 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  38.05 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  32.81 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  43.12 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  39.22 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  27.62 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  35.92 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  37.8 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  34.38 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  27.13 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  30.69 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0638  hypothetical protein  29.47 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.153268  normal  0.900639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>