19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  93.18 
 
 		 132 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  70.08 
 
 		 135 aa  163  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  56.8 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  36.51 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  39.52 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  38.46 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  40.38 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  35.51 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  40.46 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  38.83 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  28.95 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  36.54 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  37.8 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  27.69 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1105  hypothetical protein  30.21 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0816974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  31.46 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0638  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.153268  normal  0.900639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>