17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2525 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  254  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  41.94 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  38.64 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  44.95 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  32.81 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  41.35 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  35.65 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  47.44 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  29.2 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  27.36 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  27.62 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  25 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  38.3 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  27.27 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>