17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0531 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  276  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  47.06 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  41.79 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  35.29 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  44.12 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  33.08 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  39.06 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  41.9 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  27.34 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  38.61 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  30.23 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  34.75 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  37.14 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  29.13 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  27.45 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  25.51 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>