40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0706 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0706  putative signal peptide protein  100 
 
 		 407 aa  835    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.278446  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3120  phosphate-selective porin O and P  53.83 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000046634  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4035  phosphate-selective porin O and P  53.33 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0638  phosphate-selective porin O and P  53.94 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000222961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3889  phosphate-selective porin O and P  51.11 
 
 		 395 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000019269  decreased coverage  0.000370882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0589  phosphate-selective porin O and P  52.46 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000499281  unclonable  0.0000111386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2014  phosphate-selective porin O and P  52.96 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.637056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1315  putative signal peptide protein  53.26 
 
 		 372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000348515  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_3788  phosphate-selective porin O and P  50.37 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000264942  decreased coverage  0.00000068158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0712  phosphate-selective porin O and P  50.49 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000988796  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4602  hypothetical protein  49.26 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2437  hypothetical protein  46.68 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306411  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_003296  RS01730  putative signal peptide protein  31.17 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1888  phosphate-selective porin O and P  29.65 
 
 		 458 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00748844  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1559  phosphate-selective porin O and P  29.65 
 
 		 458 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2973  hypothetical protein  35.77 
 
 		 490 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000455039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1905  hypothetical protein  29.23 
 
 		 505 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1184  hypothetical protein  26.98 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0905  hypothetical protein  28.54 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2944  hypothetical protein  31.75 
 
 		 420 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140156  hitchhiker  0.0032138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2296  hypothetical protein  31.09 
 
 		 448 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.744575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2384  hypothetical protein  31.09 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0930  hypothetical protein  29.38 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000108303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2247  hypothetical protein  30.77 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1567  hypothetical protein  31.09 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0425  hypothetical protein  27.89 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000166547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0447  hypothetical protein  26.77 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0675  hypothetical protein  27.69 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0670  hypothetical protein  29.16 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0790  hypothetical protein  26.12 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3793  hypothetical protein  26.93 
 
 		 465 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000178587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0810  hypothetical protein  24.42 
 
 		 467 aa  94  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.682214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0970  hypothetical protein  24.52 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000021772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0936  hypothetical protein  24.52 
 
 		 468 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0721  hypothetical protein  25.25 
 
 		 491 aa  86.3  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2608  hypothetical protein  26.11 
 
 		 567 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0693  hypothetical protein  23.33 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0183  phosphate-selective porin O and P  23.75 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1834  hypothetical protein  26.42 
 
 		 471 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00880  phosphate-selective porin O and P  28.57 
 
 		 333 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>