38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1567 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2384  hypothetical protein  91.11 
 
 
450 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1567  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  887    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2296  hypothetical protein  93.2 
 
 
448 aa  750    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.744575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2247  hypothetical protein  63 
 
 
431 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.310158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1905  hypothetical protein  43.15 
 
 
505 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2973  hypothetical protein  41.83 
 
 
490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000455039  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0905  hypothetical protein  35.94 
 
 
451 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1184  hypothetical protein  33.09 
 
 
410 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1559  phosphate-selective porin O and P  34.13 
 
 
458 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1888  phosphate-selective porin O and P  34.13 
 
 
458 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00748844  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_003296  RS01730  putative signal peptide protein  34.93 
 
 
457 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2944  hypothetical protein  31.89 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140156  hitchhiker  0.0032138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0425  hypothetical protein  33.24 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000166547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0447  hypothetical protein  31.83 
 
 
413 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0706  putative signal peptide protein  31.09 
 
 
407 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.278446  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3120  phosphate-selective porin O and P  30.36 
 
 
390 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000046634  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0930  hypothetical protein  29.44 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000108303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2437  hypothetical protein  29.43 
 
 
398 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306411  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1315  putative signal peptide protein  30.96 
 
 
372 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000348515  n/a   
 
 
 
NC_009831  Ssed_3889  phosphate-selective porin O and P  29.25 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000019269  decreased coverage  0.000370882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0589  phosphate-selective porin O and P  30.48 
 
 
391 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000499281  unclonable  0.0000111386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0712  phosphate-selective porin O and P  28.24 
 
 
392 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000988796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3788  phosphate-selective porin O and P  29.81 
 
 
395 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000264942  decreased coverage  0.00000068158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2014  phosphate-selective porin O and P  29.24 
 
 
393 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.637056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4035  phosphate-selective porin O and P  28.85 
 
 
391 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4602  hypothetical protein  28.91 
 
 
392 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0638  phosphate-selective porin O and P  27.48 
 
 
393 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000222961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0790  hypothetical protein  25.56 
 
 
461 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0970  hypothetical protein  26.61 
 
 
468 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000021772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0936  hypothetical protein  25.83 
 
 
468 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0670  hypothetical protein  25.48 
 
 
469 aa  91.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0810  hypothetical protein  34.31 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.682214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0721  hypothetical protein  35.71 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3793  hypothetical protein  25.34 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000178587  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2608  hypothetical protein  25.87 
 
 
567 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0675  hypothetical protein  24.92 
 
 
481 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234348 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0693  hypothetical protein  24.8 
 
 
454 aa  70.1  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1834  hypothetical protein  27.38 
 
 
471 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>