37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0693 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0693  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  933    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0790  hypothetical protein  49.68 
 
 
461 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3793  hypothetical protein  48.49 
 
 
465 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000178587  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0670  hypothetical protein  52.42 
 
 
469 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0675  hypothetical protein  48.98 
 
 
481 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0810  hypothetical protein  46.27 
 
 
467 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.682214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0970  hypothetical protein  48.97 
 
 
468 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000021772  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0721  hypothetical protein  49.52 
 
 
491 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0936  hypothetical protein  49.2 
 
 
468 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104038  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1184  hypothetical protein  26.88 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2973  hypothetical protein  27.01 
 
 
490 aa  106  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000455039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3889  phosphate-selective porin O and P  27.73 
 
 
395 aa  99.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000019269  decreased coverage  0.000370882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0589  phosphate-selective porin O and P  26.87 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000499281  unclonable  0.0000111386 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0638  phosphate-selective porin O and P  27.02 
 
 
393 aa  94  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000222961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0712  phosphate-selective porin O and P  25.54 
 
 
392 aa  93.2  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000988796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3788  phosphate-selective porin O and P  27.02 
 
 
395 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000264942  decreased coverage  0.00000068158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0905  hypothetical protein  23.23 
 
 
451 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1905  hypothetical protein  24.83 
 
 
505 aa  91.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3120  phosphate-selective porin O and P  24.45 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000046634  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2014  phosphate-selective porin O and P  24.49 
 
 
393 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.637056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4602  hypothetical protein  25.76 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4035  phosphate-selective porin O and P  27.03 
 
 
391 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2247  hypothetical protein  23.06 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.310158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1315  putative signal peptide protein  23.64 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000348515  n/a   
 
 
 
NC_007404  Tbd_0706  putative signal peptide protein  23.33 
 
 
407 aa  77  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.278446  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0930  hypothetical protein  22.93 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000108303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2384  hypothetical protein  24.46 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2296  hypothetical protein  24.46 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.744575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2437  hypothetical protein  26.35 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306411  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1567  hypothetical protein  24.23 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2944  hypothetical protein  24.11 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140156  hitchhiker  0.0032138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1559  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1888  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00748844  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0425  hypothetical protein  22.31 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000166547  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01730  putative signal peptide protein  22.25 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0447  hypothetical protein  21.95 
 
 
413 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2608  hypothetical protein  25.18 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>