28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1296 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 182 aa  350  8e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  47 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  43.93 
 
 		 137 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  35.43 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  40.48 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  33.56 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  34.17 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  41.24 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  41.24 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  41.24 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0533  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  32.28 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  41.94 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  44.05 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2162  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  29.07 
 
 		 291 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1992  TPR domain-containing protein  36 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.885069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0826  hypothetical protein  39.13 
 
 		 121 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1647  hypothetical protein  27.91 
 
 		 290 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14103  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 706 aa  45.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3094  hypothetical protein  28.41 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.779162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2046  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 479 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 773 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  23.12 
 
 		 240 aa  42  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>