15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0533 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0533  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  35.65 
 
 		 137 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  27.44 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 247 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  37.65 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  35 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  37.65 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  30.56 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  37.65 
 
 		 258 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  33.03 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 870 aa  41.6  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>