26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2162 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2162  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 145 aa  293  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  50 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  43.53 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  42.35 
 
 		 266 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  39.53 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  48.39 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  46.77 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  46.77 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  46.77 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  37.65 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1992  TPR domain-containing protein  39.51 
 
 		 176 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.885069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  39.47 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30.77 
 
 		 887 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 762 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0826  hypothetical protein  32.53 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  32.88 
 
 		 612 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  34.38 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 827 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2170  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 		 446 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  40 
 
 		 676 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1742  hypothetical protein  38.1 
 
 		 451 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.199498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>