18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0088 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  271  2e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  39.1 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  48.21 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  37.59 
 
 
135 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  37.69 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  38.1 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  39.81 
 
 
132 aa  81.6  3e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  49.02 
 
 
130 aa  78.2  3e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  38.61 
 
 
141 aa  75.5  2e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  37.37 
 
 
126 aa  67.8  4e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  39.36 
 
 
129 aa  62  3e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  32.5 
 
 
150 aa  56.6  1e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  40.62 
 
 
119 aa  55.8  2e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  38.02 
 
 
126 aa  53.5  8e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  33.6 
 
 
141 aa  52.8  1e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.42569e-06 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  44.19 
 
 
131 aa  53.1  1e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  31.93 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0718  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>