18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13912 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  67.01 
 
 		 508 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  100 
 
 		 479 aa  941    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0063  hypothetical protein  69.94 
 
 		 487 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0508702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0082  hypothetical protein  69.73 
 
 		 487 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201998  decreased coverage  0.00368698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0073  hypothetical protein  69.73 
 
 		 509 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0764  hypothetical protein  65.55 
 
 		 486 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  28.61 
 
 		 528 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  27.44 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 473 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5780  hypothetical protein  38.95 
 
 		 505 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00948256  normal  0.178087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  26.19 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  23.75 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  25.05 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  24.19 
 
 		 503 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  23.57 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  23.57 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  25.35 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  23.22 
 
 		 464 aa  43.1  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>