133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10288 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10288  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  607  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59683e-26  normal  0.455495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  69.21 
 
 
325 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  66.12 
 
 
300 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  66.12 
 
 
300 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  66.12 
 
 
300 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  45.61 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  45.61 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  45.61 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  45.87 
 
 
309 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  44.62 
 
 
314 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  46.91 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  46.91 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  46.91 
 
 
312 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  44.76 
 
 
307 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  41.11 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10147  hypothetical protein  46.58 
 
 
310 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  42.99 
 
 
307 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  51.17 
 
 
312 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  43.86 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  43.25 
 
 
297 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  42.91 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  42.91 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  41.58 
 
 
305 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  45.49 
 
 
309 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  44.41 
 
 
308 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  44.41 
 
 
308 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  44.76 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  51.85 
 
 
301 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  45.1 
 
 
308 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  43.06 
 
 
306 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  41.99 
 
 
301 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  39.34 
 
 
301 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  40.07 
 
 
303 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10740  hypothetical protein  42.27 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.508563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  40.82 
 
 
310 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  43.66 
 
 
318 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  53.52 
 
 
305 aa  168  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2708  methyltransferase  39.71 
 
 
301 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  39.01 
 
 
283 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  37.11 
 
 
278 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0910  putative methyltransferase  42.73 
 
 
295 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  37.93 
 
 
298 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  38.35 
 
 
291 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  44.9 
 
 
242 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  44.9 
 
 
249 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  44.9 
 
 
249 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0168  putative methyltransferase  39.42 
 
 
246 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  36.57 
 
 
313 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0079  putative methyltransferase  46.1 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.331361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0089  hypothetical protein  46.1 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0098  putative methyltransferase  46.1 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.154609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  37.67 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  34.29 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  33.46 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3182  methyltransferase  43.59 
 
 
313 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0738  putative methyltransferase  41.67 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  37.88 
 
 
798 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  38.73 
 
 
291 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0879  hypothetical protein  35.55 
 
 
329 aa  102  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  32.84 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  33.16 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  26.12 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  32.08 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11917  hypothetical protein  44.17 
 
 
118 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  32.31 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30355  predicted protein  41.73 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  29.12 
 
 
209 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  33.71 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  28.93 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  30.66 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  29.44 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0683  methyltransferase  33.33 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5836  putative methyltransferase  32.4 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  29.05 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  31.8 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  33.86 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  32.35 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  33.7 
 
 
276 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3430  hypothetical protein  29.89 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40430  hypothetical protein  29.35 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  34.92 
 
 
286 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  34.92 
 
 
286 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  33.87 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  32.8 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  36.36 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  36.36 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  36.36 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0649  methyltransferase  31.43 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  34.92 
 
 
286 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  36.36 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  30.3 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  33.33 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
648 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  36.36 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0666  O-methyltransferase domain-containing protein  30.05 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.622962  normal  0.600232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  30.89 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
639 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  32.74 
 
 
304 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  30.86 
 
 
285 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  35 
 
 
351 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>