66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10086 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10086  hydrogenase hycP  100 
 
 
220 aa  410  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  9.6186e-11  normal  0.18173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4705  hypothetical protein  49.55 
 
 
218 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2987  hypothetical protein  47.27 
 
 
220 aa  147  1e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0295877  hitchhiker  0.00167925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4467  putative hydrogenase HycP  51.36 
 
 
220 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4286  hypothetical protein  35.71 
 
 
218 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00379585  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  32.08 
 
 
219 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  32.08 
 
 
219 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  30.66 
 
 
219 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  31.6 
 
 
219 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  32.08 
 
 
219 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  31.6 
 
 
219 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  31.6 
 
 
219 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  29.25 
 
 
219 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  34.11 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  31.86 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.45 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  31.65 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.68 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  30.14 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.09 
 
 
213 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.55 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  31.37 
 
 
219 aa  91.7  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.62 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  25.37 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.25 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  31.16 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.15 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2151  hydrogenase-4, E subunit  34.02 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1809  hydrogenase 4 membrane component  34.02 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.28 
 
 
213 aa  84.7  1e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.28 
 
 
213 aa  84.3  1e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.44 
 
 
215 aa  83.2  3e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.15 
 
 
215 aa  83.2  3e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.15 
 
 
215 aa  82.8  3e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  33.04 
 
 
226 aa  82.8  4e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.19 
 
 
215 aa  79.7  3e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  24.55 
 
 
222 aa  76.6  2e-13  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  32.89 
 
 
220 aa  75.5  5e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  41.11 
 
 
193 aa  73.6  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  31.55 
 
 
220 aa  73.6  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  41.11 
 
 
193 aa  73.6  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  26.96 
 
 
216 aa  72.4  5e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  31.55 
 
 
220 aa  72  7e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  35.29 
 
 
229 aa  71.6  8e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  25.67 
 
 
215 aa  70.9  1e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  30.04 
 
 
226 aa  64.7  1e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0931  hypothetical protein  31.1 
 
 
220 aa  63.5  3e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  23.08 
 
 
210 aa  61.2  1e-08  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  25.45 
 
 
217 aa  59.7  4e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4572  hydrogenase 4 membrane subunit  23.61 
 
 
217 aa  53.5  3e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1282  hydrogenase 4 membrane subunit  24.31 
 
 
216 aa  53.1  3e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.077695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2711  hydrogenase 4 membrane subunit  26.01 
 
 
216 aa  52.4  5e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0776  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.44 
 
 
207 aa  49.3  4e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1125  hydrogenase-4 component E  25.39 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457842  normal  0.790146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1995  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.829776  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.08 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0730  hydrogenase subunit  28.33 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0129986  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02377  hydrogenase 4, membrane subunit  27.52 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2619  hydrogenase 4 membrane subunit  27.52 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02339  hypothetical protein  27.52 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2857  hydrogenase 4 membrane subunit  27.52 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3707  hydrogenase 4 membrane subunit  28.44 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2767  hydrogenase 4 membrane subunit  27.52 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1191  hydrogenase 4 membrane subunit  27.52 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2632  hydrogenase 4 membrane subunit  24.55 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1184  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.52 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>