29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2605 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2605  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.103693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3960  hypothetical protein  34.35 
 
 
168 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.83 
 
 
1141 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1255  hypothetical protein  32.54 
 
 
191 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1225  hypothetical protein  32.54 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4551  hypothetical protein  29.77 
 
 
188 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3835  hypothetical protein  30.97 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.916575  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  32.48 
 
 
356 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1972  hypothetical protein  41.18 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1281  hypothetical protein  32.61 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.582719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.2 
 
 
440 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  32.14 
 
 
340 aa  48.5  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  33.63 
 
 
841 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2634  type II secretion system protein E  35.44 
 
 
626 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0054  hypothetical protein  41.67 
 
 
116 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  51.92 
 
 
561 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  28.26 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3007  hypothetical protein  38.24 
 
 
134 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117805  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  51.02 
 
 
561 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16020  hypothetical protein  39.68 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0394744  normal  0.745254 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  45.24 
 
 
563 aa  42.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4788  hypothetical protein  37.35 
 
 
99 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.175046  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  42.11 
 
 
574 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  33.33 
 
 
277 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  48.94 
 
 
559 aa  42  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  29.79 
 
 
553 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1172  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  33.9 
 
 
247 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  37.04 
 
 
644 aa  41.6  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3946  hypothetical protein  35.21 
 
 
438 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>