29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1528 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1528  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  221  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462653  hitchhiker  0.00252515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2746  hypothetical protein  60.36 
 
 
111 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1756  hypothetical protein  62.63 
 
 
105 aa  130  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3374  hypothetical protein  60.61 
 
 
102 aa  130  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730978  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0790  hypothetical protein  59.6 
 
 
101 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4478  hypothetical protein  60.4 
 
 
109 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4049  hypothetical protein  55.21 
 
 
100 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4011  hypothetical protein  55.21 
 
 
100 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1426  hypothetical protein  52.69 
 
 
97 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0573286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1073  hypothetical protein  56.18 
 
 
91 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11197  predicted protein  49.44 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0896  hypothetical protein  46.88 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.287501  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09551  hypothetical protein  51.69 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09571  hypothetical protein  47.87 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0197216  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09861  hypothetical protein  44.68 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08561  hypothetical protein  47 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011717 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9615  predicted protein  48.31 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15331  hypothetical protein  46 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09751  hypothetical protein  46 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.611374  normal  0.433211 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0303  hypothetical protein  45 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.675894  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9544  predicted protein  47.19 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61531  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9601  predicted protein  43.18 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0034  hypothetical protein  35.24 
 
 
230 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0043  hypothetical protein  32.69 
 
 
239 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0021  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0154807  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0015  hypothetical protein  31.43 
 
 
231 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0022  hypothetical protein  35.23 
 
 
224 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00321696  hitchhiker  0.00325564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0028  hypothetical protein  41.27 
 
 
228 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>