41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4845 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4845  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  816    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4452  hypothetical protein  67.34 
 
 
394 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4179  hypothetical protein  68.1 
 
 
403 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3769  hypothetical protein  62.53 
 
 
383 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0086  hypothetical protein  58.82 
 
 
412 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3965  hypothetical protein  61.84 
 
 
401 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0075  hypothetical protein  45.66 
 
 
400 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0079  hypothetical protein  43.75 
 
 
158 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  25.84 
 
 
439 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1819  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  21.69 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  21.43 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  22.56 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  22.84 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  22.51 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  22.22 
 
 
421 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  23.5 
 
 
386 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  23.5 
 
 
357 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  23.64 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  23.35 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  23.86 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  20.82 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  23.21 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  28 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  27.43 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  21.7 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  20.95 
 
 
420 aa  53.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2088  putative esterase  28 
 
 
366 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  24.65 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  22.5 
 
 
307 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  22.87 
 
 
412 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  22.63 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  23.78 
 
 
448 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  32.1 
 
 
298 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  32.29 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  30.2 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  24.65 
 
 
445 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  25.24 
 
 
288 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  25.37 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  38.18 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  23.56 
 
 
288 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>