20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2518 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2518  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.356894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1207  hypothetical protein  32.24 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.131804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0019  hypothetical protein  34.98 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0324  hypothetical protein  32.45 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0397  hypothetical protein  32.45 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1101  type VI secretion-associated protein, family  30.95 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0236  type VI secretion-associated protein, VC_A0118 family  30.25 
 
 		 247 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4073  hypothetical protein  33.18 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000242305  unclonable  0.000000767708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0228  type VI secretion-associated protein  29.83 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0230  type VI secretion-associated protein  29.83 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1220  type VI secretion-associated protein  30.48 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3722  hypothetical protein  29.33 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2625  hypothetical protein  33.68 
 
 		 231 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0930026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2128  hypothetical protein  33.68 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0055  hypothetical protein  31.94 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3223  hypothetical protein  31.94 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2796  type VI secretion-associated protein, VC_A0118 family  27.09 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3244  type VI secretion-associated protein, VC_A0118 family  29.46 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1081  type VI secretion-associated protein, VC_A0118 family  28.68 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.212059  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6163  hypothetical protein  22.51 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>