31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1810 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  654  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.00473e-07  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  68.71 
 
 
315 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.62067e-08  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  54.14 
 
 
312 aa  327  1e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.1783e-08  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  52.32 
 
 
335 aa  316  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.0026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  42.12 
 
 
330 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.4454e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  41.51 
 
 
382 aa  244  1e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.17038e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  40.74 
 
 
333 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  7.71271e-08  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  40.74 
 
 
333 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.13685e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  40.74 
 
 
333 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  40.74 
 
 
333 aa  239  3e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  9.06332e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  39.44 
 
 
336 aa  234  2e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  40.06 
 
 
332 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  38.3 
 
 
341 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  38.78 
 
 
342 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  38.66 
 
 
343 aa  221  1e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  35.64 
 
 
394 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  35.42 
 
 
266 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  27.76 
 
 
254 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  28.95 
 
 
296 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  32.4 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  31.98 
 
 
243 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  27.47 
 
 
475 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  37.5 
 
 
565 aa  73.9  4e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02438  hypothetical protein  32.35 
 
 
509 aa  69.7  5e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.477602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1357  hypothetical protein  23.81 
 
 
246 aa  52.8  8e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  32.1 
 
 
208 aa  49.7  7e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.81695e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  21.14 
 
 
268 aa  49.3  7e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  24.71 
 
 
222 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  23.87 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  24.71 
 
 
184 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  24.71 
 
 
184 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>