196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1105 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  100 
 
 
557 aa  1126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  41.13 
 
 
569 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  41.4 
 
 
588 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  41.32 
 
 
573 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  40.77 
 
 
578 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  41.87 
 
 
577 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  40.88 
 
 
570 aa  423  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  41.39 
 
 
578 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  41.58 
 
 
570 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  39.05 
 
 
576 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  40.22 
 
 
574 aa  416  1e-115  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  40.46 
 
 
571 aa  416  1e-115  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  41.05 
 
 
594 aa  418  1e-115  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  41.05 
 
 
578 aa  417  1e-115  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.11495e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  40.24 
 
 
580 aa  416  1e-115  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  40.77 
 
 
580 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  39.08 
 
 
598 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  40.78 
 
 
576 aa  402  1e-110  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  40.78 
 
 
576 aa  402  1e-110  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  1.29938e-09 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  39.96 
 
 
574 aa  400  1e-110  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  40.52 
 
 
580 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  5.65114e-10 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  38.14 
 
 
584 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  38.35 
 
 
574 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  39.61 
 
 
574 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  38.41 
 
 
584 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  38.65 
 
 
578 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.51601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  38.34 
 
 
580 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  39.18 
 
 
614 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  38.99 
 
 
572 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  38.99 
 
 
572 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  38.64 
 
 
573 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  38.68 
 
 
572 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  38.81 
 
 
573 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.0928e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  38.81 
 
 
573 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.26901e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  38.81 
 
 
573 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.48289e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  38.81 
 
 
572 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  38.81 
 
 
572 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  39.18 
 
 
642 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  39.02 
 
 
572 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.21598e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  38.64 
 
 
572 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  38.64 
 
 
572 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  37.46 
 
 
576 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  38.83 
 
 
650 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  38.69 
 
 
576 aa  369  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  37.21 
 
 
560 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  35.92 
 
 
579 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  34.98 
 
 
584 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.64 
 
 
740 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  35.09 
 
 
569 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  37.57 
 
 
562 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  35.54 
 
 
589 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  37.17 
 
 
592 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  35.4 
 
 
558 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  37.11 
 
 
574 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  37 
 
 
592 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  35.96 
 
 
592 aa  345  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  36.71 
 
 
580 aa  343  5e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  37.39 
 
 
582 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  37.39 
 
 
582 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  36.92 
 
 
577 aa  342  1e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  35.45 
 
 
562 aa  339  8e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  36.05 
 
 
582 aa  336  6e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4013  phosphotransferase domain-containing protein  35.21 
 
 
578 aa  336  8e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  34.5 
 
 
570 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  33.97 
 
 
576 aa  334  3e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  36.65 
 
 
592 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  35.27 
 
 
583 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  35.85 
 
 
586 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  34.34 
 
 
560 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0820  phosphotransferase domain-containing protein  35.93 
 
 
575 aa  330  5e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1798  family X DNA polymerase IV  36.8 
 
 
589 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  34.38 
 
 
570 aa  328  1e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  34.38 
 
 
570 aa  328  1e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  36.87 
 
 
543 aa  327  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  35.82 
 
 
588 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  33.33 
 
 
569 aa  319  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  34.17 
 
 
557 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  32.58 
 
 
586 aa  316  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  33.96 
 
 
586 aa  316  7e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4147  PHP-like  35.75 
 
 
591 aa  315  2e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3298  phosphotransferase domain-containing protein  35.75 
 
 
591 aa  315  2e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.565465  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4219  phosphotransferase domain-containing protein  35.75 
 
 
591 aa  315  2e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257415  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3642  phosphotransferase domain-containing protein  35.69 
 
 
592 aa  314  3e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4117  phosphotransferase domain-containing protein  35.87 
 
 
592 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  32.09 
 
 
566 aa  310  3e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  33.45 
 
 
563 aa  306  5e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  32.99 
 
 
577 aa  300  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  33.27 
 
 
532 aa  296  7e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  32.54 
 
 
536 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0442  PHP domain protein  35.69 
 
 
605 aa  290  4e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.372194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  48.39 
 
 
650 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  31.18 
 
 
572 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  32.64 
 
 
572 aa  253  8e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2809  phosphotransferase domain-containing protein  42.14 
 
 
621 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102526  hitchhiker  0.000714673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  39.03 
 
 
334 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  39.03 
 
 
334 aa  185  2e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  39.03 
 
 
334 aa  185  2e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  40.68 
 
 
339 aa  183  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  37.55 
 
 
334 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  38.04 
 
 
356 aa  176  1e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>