20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0746 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  731    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0834  hypothetical protein  42.3 
 
 
364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  39.55 
 
 
380 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  41.6 
 
 
372 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  40.92 
 
 
380 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  41.79 
 
 
370 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2305  hypothetical protein  41.43 
 
 
369 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  40.45 
 
 
375 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  41.13 
 
 
358 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  38.46 
 
 
361 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  39.37 
 
 
375 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  37.86 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  25 
 
 
354 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  25 
 
 
354 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  25.13 
 
 
354 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  23.12 
 
 
422 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  25.76 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  20.56 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4361  hypothetical protein  21.4 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5364  dgqhr domain, putative  26.45 
 
 
415 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00112858  hitchhiker  0.00000000329618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>