19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5193 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5193  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5593  hypothetical protein  36.32 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6525  hypothetical protein  34.32 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6237  hypothetical protein  32.9 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3824  hypothetical protein  28.22 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0937029  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5242  hypothetical protein  30.17 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1601  hypothetical protein  30.17 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5507  hypothetical protein  32.35 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.467204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1659  hypothetical protein  33.94 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5024  hypothetical protein  30.21 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1595  hypothetical protein  31.58 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.691344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2538  hypothetical protein  29.49 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5066  hypothetical protein  28.76 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2985  hypothetical protein  33.02 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4407  hypothetical protein  26.07 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4296  hypothetical protein  24.89 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.337825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3233  hypothetical protein  31.43 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4312  hypothetical protein  25.25 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0538  hypothetical protein  26.03 
 
 		 212 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>