33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5191 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5191  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511652 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.96 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1657  hypothetical protein  44.84 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0920215  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4298  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.82 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.232236 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4405  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.11 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.68 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.454327 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5068  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.43 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.8 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.5 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.918479  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.7 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1603  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.37 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.26 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6523  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.02 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2986  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.45 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5595  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.19 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.74 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0540  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.19 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  26.98 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0069  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.1 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.701248  normal  0.470884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.84 
 
 		 456 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0100  hypothetical protein  42.03 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0405921  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0065  ThiF family protein  38.16 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0042  ThiF family protein  38.16 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000190177 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1283  thiamine biosynthesis protein ThiF family protein  27.84 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.25 
 
 		 604 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.63 
 
 		 604 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02000  NEDD8 activating enzyme, putative  30.71 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33774  ubiquitin-activating enzyme E1, protein 3  32.8 
 
 		 462 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30829  predicted protein  37.93 
 
 		 433 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.47 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0037  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.45 
 
 		 320 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2472  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.69 
 
 		 367 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.935376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>