279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1403 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  67.79 
 
 		 211 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  61.54 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  63.94 
 
 		 210 aa  265  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  63.94 
 
 		 210 aa  265  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  64.9 
 
 		 211 aa  264  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  62.5 
 
 		 210 aa  263  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  62.02 
 
 		 210 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  62.5 
 
 		 210 aa  261  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  62.5 
 
 		 210 aa  260  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  61.72 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  63.81 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  64.29 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  59.52 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  63.64 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  61.46 
 
 		 209 aa  257  8e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  60.58 
 
 		 210 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  60.29 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  65.22 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  60.95 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  63.16 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  61.9 
 
 		 212 aa  255  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  62.68 
 
 		 212 aa  255  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  59.52 
 
 		 212 aa  254  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  60.95 
 
 		 212 aa  254  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  60.48 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  60.58 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  62.98 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  60.29 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  62.38 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  63.29 
 
 		 210 aa  247  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  59.42 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  61.84 
 
 		 210 aa  245  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  61.06 
 
 		 210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  59.9 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  59.9 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  59.22 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  59.42 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  58.94 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  53.7 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  59.42 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  59.42 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  56.54 
 
 		 215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  58.45 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  58.94 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  59.42 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  57.97 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  57.97 
 
 		 210 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  60.19 
 
 		 212 aa  237  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  57.49 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  57.49 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  57.49 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  57.49 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  57.49 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  57.49 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  57.49 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  53.42 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  51.39 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  49.07 
 
 		 216 aa  228  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  52.78 
 
 		 218 aa  228  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  58.74 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  64.73 
 
 		 210 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  53.37 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  54.26 
 
 		 224 aa  222  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  61.9 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  52.58 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  52.82 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  43.7 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  34.42 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  34.12 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  38.03 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  35.05 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  35.68 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  31.63 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.14 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  33.03 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  30.14 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  28.69 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  31.9 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  32.9 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  32.9 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  31.2 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  30.4 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  37.96 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  32.76 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  32.49 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  29.96 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  32.05 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  28.57 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  32.17 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>