More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18640  flavodoxin reductase family protein  100 
 
 
355 aa  716    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  49.26 
 
 
347 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  48.25 
 
 
352 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  49.16 
 
 
358 aa  322  7e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  51.06 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  51.06 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  50.15 
 
 
339 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.09 
 
 
345 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  47.08 
 
 
358 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  51.37 
 
 
350 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  51.37 
 
 
350 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  51.37 
 
 
350 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  48.22 
 
 
356 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  52.17 
 
 
351 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  46.74 
 
 
354 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  45.72 
 
 
340 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  44.62 
 
 
366 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  44.51 
 
 
353 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  43.33 
 
 
348 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3851  ferredoxin  44.34 
 
 
360 aa  255  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  44.65 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.88 
 
 
346 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.86 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  36.52 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  37.12 
 
 
339 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  37.12 
 
 
339 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  37.12 
 
 
339 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  36.64 
 
 
344 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  37.58 
 
 
346 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.12 
 
 
341 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  38.72 
 
 
339 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3372  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.6 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.51 
 
 
389 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1502  ferredoxin  36.16 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.98 
 
 
365 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.31 
 
 
329 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.77 
 
 
362 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.42 
 
 
362 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.25 
 
 
358 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.87 
 
 
358 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.47 
 
 
358 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0608  ferredoxin reductase protein  34.2 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.52 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.9 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.24 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.52 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.87 
 
 
365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.1 
 
 
348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.5 
 
 
357 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  35.59 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.88 
 
 
380 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.59 
 
 
380 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.31 
 
 
381 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.31 
 
 
380 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.31 
 
 
380 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.31 
 
 
380 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.24 
 
 
356 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5717  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.75 
 
 
369 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  34.88 
 
 
379 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.86 
 
 
382 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.24 
 
 
358 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.43 
 
 
362 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.66 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  35.35 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.08 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.87 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  30.52 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.87 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.65 
 
 
368 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  34.29 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.29 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.71 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20190  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.07 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.864548  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3155  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.61 
 
 
353 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.42 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  34.35 
 
 
361 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  34.8 
 
 
685 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  32.39 
 
 
372 aa  162  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  33.69 
 
 
418 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3373  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  30.95 
 
 
361 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.36 
 
 
358 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  34.29 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.47 
 
 
349 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.1 
 
 
369 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  35.06 
 
 
382 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  33.24 
 
 
358 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.62 
 
 
383 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  29.23 
 
 
357 aa  159  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.29 
 
 
356 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.29 
 
 
356 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.29 
 
 
356 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09330  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.39 
 
 
371 aa  156  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.24 
 
 
385 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  29.95 
 
 
344 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.99 
 
 
356 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.95 
 
 
365 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2477  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.24 
 
 
367 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  32.86 
 
 
379 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.02 
 
 
351 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3822  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.79 
 
 
356 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal  0.275552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>