More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  100 
 
 
324 aa  643    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  70.77 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  65.65 
 
 
329 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  64.63 
 
 
328 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  64.4 
 
 
324 aa  411  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  63.27 
 
 
325 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  65.22 
 
 
320 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  62.97 
 
 
324 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  62.2 
 
 
343 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  60.37 
 
 
333 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  60.95 
 
 
327 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  60.95 
 
 
327 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.95 
 
 
327 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  63.58 
 
 
325 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  61.66 
 
 
316 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  64.81 
 
 
325 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.59 
 
 
327 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  59.2 
 
 
327 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  61.86 
 
 
325 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  58.02 
 
 
324 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  58.73 
 
 
328 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  62.23 
 
 
318 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.2 
 
 
326 aa  357  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  59.94 
 
 
317 aa  351  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  60.06 
 
 
329 aa  348  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4322  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.47 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  56.66 
 
 
353 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  54.83 
 
 
328 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.41 
 
 
325 aa  331  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  54.83 
 
 
328 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  52.02 
 
 
325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  52.02 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  51.99 
 
 
328 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.2 
 
 
332 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.23 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.08 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.92 
 
 
323 aa  311  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.71 
 
 
334 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01790  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  57.27 
 
 
332 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  51.52 
 
 
334 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  47.84 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.91 
 
 
327 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 
332 aa  305  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.45 
 
 
334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  48.62 
 
 
389 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  47.53 
 
 
335 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  50 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.69 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.66 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.69 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  50.15 
 
 
338 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
328 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.15 
 
 
332 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  47.55 
 
 
336 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  47.55 
 
 
336 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  47.68 
 
 
332 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0397  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.45 
 
 
327 aa  299  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  47.55 
 
 
336 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.15 
 
 
338 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  48.44 
 
 
332 aa  298  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.6 
 
 
334 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1057  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  51.05 
 
 
339 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.17 
 
 
333 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  48.95 
 
 
339 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.95 
 
 
339 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50.45 
 
 
339 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50.45 
 
 
339 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.45 
 
 
339 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50.45 
 
 
339 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50.45 
 
 
339 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50.45 
 
 
360 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  49.53 
 
 
328 aa  294  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3259  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.08 
 
 
340 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  50.15 
 
 
333 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  47.83 
 
 
322 aa  293  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.31 
 
 
335 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.69 
 
 
328 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  50.46 
 
 
336 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.23 
 
 
335 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1295  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.15 
 
 
360 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0519873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.46 
 
 
336 aa  292  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.25 
 
 
339 aa  291  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.23 
 
 
335 aa  291  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.22 
 
 
332 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.46 
 
 
336 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.99 
 
 
332 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  48.49 
 
 
334 aa  289  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 
353 aa  288  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  48.01 
 
 
333 aa  288  8e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.65 
 
 
339 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000917722  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.54 
 
 
334 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
339 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
339 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.54 
 
 
326 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.35 
 
 
339 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129924  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.54 
 
 
338 aa  285  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.68 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.64 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103733  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.01 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>