21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4200 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  46.79 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  41.79 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  38.77 
 
 		 336 aa  188  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  38.29 
 
 		 300 aa  185  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  37.18 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  37.18 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  38.49 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  36.8 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  34.63 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  38.49 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  32.3 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  32.62 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  32.38 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  32.49 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  30.88 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  34.77 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  34.77 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 		 444 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  23.14 
 
 		 453 aa  75.9  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  22.74 
 
 		 428 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>