More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1503 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
272 aa  563  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  95.96 
 
 
272 aa  547  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  91.54 
 
 
272 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  92.65 
 
 
272 aa  529  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  92.65 
 
 
272 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  92.65 
 
 
272 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  92.65 
 
 
272 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  91.54 
 
 
272 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  91.54 
 
 
272 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  91.91 
 
 
272 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  91.54 
 
 
272 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  91.54 
 
 
272 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  93.56 
 
 
264 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  90.81 
 
 
272 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  90.44 
 
 
272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  88.97 
 
 
272 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  76.7 
 
 
279 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  73.53 
 
 
272 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  73.53 
 
 
272 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  77.61 
 
 
273 aa  428  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  76.86 
 
 
277 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  73.53 
 
 
272 aa  417  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  73.7 
 
 
277 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 
281 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 
277 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  72.32 
 
 
277 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 
277 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  72.32 
 
 
277 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
270 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  70.74 
 
 
277 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  72.59 
 
 
277 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  71.48 
 
 
277 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1347  phosphate transporter ATP-binding protein  73.36 
 
 
270 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1230  phosphate transporter ATP-binding protein  73.36 
 
 
270 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  73.33 
 
 
285 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3116  phosphate transporter ATP-binding protein  73.36 
 
 
262 aa  401  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.83 
 
 
276 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  70 
 
 
276 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  72 
 
 
285 aa  394  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  70.08 
 
 
272 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  71.2 
 
 
284 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  72.16 
 
 
283 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  71.32 
 
 
271 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  69.11 
 
 
271 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 
271 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5484  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  72.94 
 
 
277 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2669  phosphate transporter ATP-binding protein  69.11 
 
 
271 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  64.37 
 
 
268 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  66.29 
 
 
261 aa  367  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  66.8 
 
 
258 aa  360  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  67.07 
 
 
253 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  65.99 
 
 
260 aa  358  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.4 
 
 
251 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  64.17 
 
 
253 aa  352  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.78 
 
 
253 aa  351  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  66.27 
 
 
257 aa  351  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 
262 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 
262 aa  349  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  66.4 
 
 
252 aa  349  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.14 
 
 
255 aa  348  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  62.75 
 
 
262 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.75 
 
 
252 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.31 
 
 
292 aa  346  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  65.02 
 
 
255 aa  345  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.54 
 
 
301 aa  345  3e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  64.75 
 
 
256 aa  345  5e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.87 
 
 
258 aa  345  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.75 
 
 
252 aa  345  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4289  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
271 aa  344  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4349  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
271 aa  344  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4171  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
271 aa  344  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4009  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
271 aa  344  8e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4019  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
271 aa  344  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4402  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
271 aa  344  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 
260 aa  344  8e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4493  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
271 aa  344  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.8 
 
 
251 aa  344  8e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4385  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
271 aa  343  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0851  phosphate transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
271 aa  343  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2997  phosphate transporter ATP-binding protein  63.35 
 
 
271 aa  343  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 
251 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.49 
 
 
254 aa  342  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.63 
 
 
273 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
251 aa  341  7e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.95 
 
 
253 aa  341  8e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.16 
 
 
251 aa  341  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1616  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.67 
 
 
260 aa  341  9e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191963  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  63.56 
 
 
249 aa  340  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 
253 aa  340  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 
269 aa  340  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05140  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 
249 aa  340  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
275 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4122  phosphate transporter ATP-binding protein  60.75 
 
 
271 aa  339  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.84 
 
 
260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  62.99 
 
 
253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  62.99 
 
 
253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  60.38 
 
 
265 aa  338  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
253 aa  338  4e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.38 
 
 
267 aa  338  7e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
251 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>