13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0026 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2023  hypothetical protein  71.01 
 
 		 618 aa  797    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434949  normal  0.479969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2926  hypothetical protein  74.28 
 
 		 944 aa  1314    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3406  hypothetical protein  46.38 
 
 		 893 aa  795    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0026  hypothetical protein  100 
 
 		 940 aa  1863    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00859162  normal  0.584217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2020  hypothetical protein  80.8 
 
 		 350 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115091  normal  0.412427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  26.15 
 
 		 763 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  26.21 
 
 		 830 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  25.97 
 
 		 763 aa  51.6  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  28.36 
 
 		 812 aa  47.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  24.45 
 
 		 735 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  29.48 
 
 		 1295 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  23.43 
 
 		 755 aa  46.2  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  27.49 
 
 		 755 aa  45.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>