63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1692 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  293  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2131  protein of unknown function DUF606  42.75 
 
 
158 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  37.68 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  36.62 
 
 
145 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2290  hypothetical protein  40.48 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1792  hypothetical protein  33.64 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  33.64 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3512  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3257  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3167  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3230  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  57  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000207849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3472  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3164  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  32.74 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  32.73 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  31.11 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  27.52 
 
 
307 aa  53.9  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  26.9 
 
 
386 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  28.44 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  28.44 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  28.44 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  41.56 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  41.56 
 
 
172 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  40.26 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  40.85 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  29.73 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  27.52 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  38.46 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  38.46 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  31.58 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  27.52 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  29.58 
 
 
317 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  25.69 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  25.69 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  32.69 
 
 
318 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  24.77 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  37.33 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  29.82 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  40.82 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  33.72 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  29.89 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  28.36 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  30.28 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  31.69 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  30.43 
 
 
309 aa  42  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  30.43 
 
 
309 aa  42  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  29.87 
 
 
146 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  30.28 
 
 
170 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  34.25 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  34.25 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  34.25 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  31.08 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  26.19 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  35.21 
 
 
147 aa  40.8  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  29.63 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  27.14 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  29.79 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  35.53 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0520  protein of unknown function DUF606  29.36 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000146462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>