31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0856 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0856  transcriptional activator Ogr/delta  100 
 
 		 72 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000414293  hitchhiker  0.000248698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  62.69 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  58.33 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  58.33 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  58.33 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  67.65 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  58.33 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  62.5 
 
 		 72 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  62.5 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  62.5 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  62.5 
 
 		 72 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  62.5 
 
 		 72 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  57.97 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  56.52 
 
 		 71 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  64.41 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  56.52 
 
 		 71 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  62.71 
 
 		 63 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  51.43 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  54.41 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  52.38 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  63.27 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2956  phage transcriptional activator, Ogr/delta  53.23 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000761798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  57.14 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0050  transcriptional activator Ogr/delta  60.78 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  40.58 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1060  transcriptional activator Ogr/delta  48.89 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  42.42 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0741  putative phage zinc-binding transcriptional activator  36.51 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  39.13 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1904  putative transcriptional activator transcription regulator protein  36.49 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00444501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2666  transcriptional activator Ogr/delta  34.78 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.058976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>