14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3499 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  79.45 
 
 
231 aa  363  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  74.67 
 
 
227 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  29.36 
 
 
222 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  27.43 
 
 
226 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  27.23 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  29.01 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  29.45 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05427  hypothetical protein  75 
 
 
56 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  25.62 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  22.47 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  21.65 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  22.4 
 
 
218 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  24.82 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>