246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0082 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0082  flagellar motor switch protein G  100 
 
 
337 aa  677  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0076  flagellar motor switch protein G  87.24 
 
 
337 aa  594  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3978  flagellar motor switch protein G  81.35 
 
 
328 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3475  flagellar motor switch protein G  81.04 
 
 
328 aa  544  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3658  flagellar motor switch protein G  78.51 
 
 
338 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04974  flagellar motor switch protein G  44.31 
 
 
339 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4416  flagellar motor switch protein FliG  43.9 
 
 
354 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.202988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0251  flagellar motor switch protein G  43.75 
 
 
336 aa  273  2e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3381  flagellar motor switch protein G  43.45 
 
 
336 aa  272  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001187  flagellar motor switch protein FliG  44.41 
 
 
295 aa  269  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0233  flagellar motor switch protein G  42.98 
 
 
347 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0632  flagellar motor switch protein G  42.98 
 
 
347 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0712  flagellar motor switch protein G  42.98 
 
 
347 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3564  flagellar motor switch protein G  35.67 
 
 
350 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0172  flagellar motor switch protein G  37.54 
 
 
337 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4656  flagellar motor switch protein G  36.96 
 
 
350 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.508113  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0224  flagellar motor switch protein G  37.54 
 
 
337 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  30.84 
 
 
337 aa  164  2e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  31.68 
 
 
346 aa  162  5e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  31 
 
 
338 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  31 
 
 
338 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  30.79 
 
 
329 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  32.09 
 
 
334 aa  162  8e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  32.09 
 
 
347 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  30.49 
 
 
339 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  31.31 
 
 
338 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  30.49 
 
 
339 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  30.49 
 
 
339 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  30.79 
 
 
339 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  31.46 
 
 
339 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  32.44 
 
 
346 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  32.91 
 
 
338 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  31.15 
 
 
338 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  31.46 
 
 
351 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  30.84 
 
 
346 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  30.86 
 
 
337 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  31.86 
 
 
331 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  31 
 
 
338 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  30 
 
 
329 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  30 
 
 
329 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  30.91 
 
 
331 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  30.7 
 
 
351 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  30.45 
 
 
351 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  31.09 
 
 
350 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  31.37 
 
 
351 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  30.84 
 
 
333 aa  152  9e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  31.75 
 
 
331 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  29.94 
 
 
333 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  32.52 
 
 
345 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  31.17 
 
 
334 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 
331 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 
331 aa  148  1e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  32.06 
 
 
339 aa  147  2e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  31.97 
 
 
332 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  31.27 
 
 
348 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  32.38 
 
 
340 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  32.38 
 
 
340 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  31.5 
 
 
347 aa  145  7e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  31.46 
 
 
336 aa  145  7e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  31.46 
 
 
336 aa  145  7e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  31.46 
 
 
349 aa  145  7e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  31.19 
 
 
348 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  30.63 
 
 
350 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  30.63 
 
 
348 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  30.63 
 
 
350 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  30.63 
 
 
348 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  30.63 
 
 
350 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  30.79 
 
 
348 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  30.63 
 
 
350 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  30.63 
 
 
348 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  30.94 
 
 
331 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  30.72 
 
 
331 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  30.94 
 
 
349 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  28.08 
 
 
340 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  30.5 
 
 
351 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  30.7 
 
 
349 aa  140  2e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  30.49 
 
 
333 aa  140  2e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  30.28 
 
 
334 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  30.43 
 
 
333 aa  137  3e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  27.88 
 
 
337 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  28.08 
 
 
342 aa  135  1e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  25.95 
 
 
330 aa  132  7e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  28.89 
 
 
331 aa  132  8e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  28.89 
 
 
331 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  27.88 
 
 
337 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  28.22 
 
 
333 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  28.12 
 
 
331 aa  129  9e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  29.5 
 
 
335 aa  128  1e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  27.04 
 
 
335 aa  127  2e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  29.5 
 
 
335 aa  128  2e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  28.17 
 
 
334 aa  127  2e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1441  flagellar motor switch protein FliG  26.27 
 
 
339 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4169  flagellar motor switch protein FliG  30.57 
 
 
331 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  28.08 
 
 
331 aa  126  4e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  28.08 
 
 
331 aa  126  4e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24220  flagellar motor switch protein  30.75 
 
 
331 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00171195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  25.62 
 
 
330 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  28.08 
 
 
331 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  26.27 
 
 
335 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  26.5 
 
 
330 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>