More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0034 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187046  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0008  tRNA-Glu  97.14 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0060  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0046  tRNA-Glu  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.960937  normal  0.776399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0045  tRNA-Glu  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.942532  normal  0.960719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0064  tRNA-Glu  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0023  tRNA-Glu  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0065  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0018  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0067  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0066  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.659746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0032  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.362082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2128  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0021  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0048  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0047  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0046  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0040  tRNA-Glu  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000578854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0045  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t38  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444842  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t40  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.1195  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t42  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0670416  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2828  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000743233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t067  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t20  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t22  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t30  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt27  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R33  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R35  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R62  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R64  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R66  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0095  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000187463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0097  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00001173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0098  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00699861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0099  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0236458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0100  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0345698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0101  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0318597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0110  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000963161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23580  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0268964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0061  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0063  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000126718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0064  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000354559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0065  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0067  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>