68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4095 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  100 
 
 
196 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  46.07 
 
 
205 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 
201 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
210 aa  121  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  43.98 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 
210 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  45.22 
 
 
224 aa  107  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  38.58 
 
 
197 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  38.58 
 
 
197 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  38.58 
 
 
197 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  38.3 
 
 
249 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 
223 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  37.3 
 
 
192 aa  89  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  36.04 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  31.37 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 
150 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
142 aa  55.1  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  46.38 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  41.46 
 
 
213 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  29.41 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
206 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
182 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  29.41 
 
 
188 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  41.94 
 
 
149 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
171 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  23.23 
 
 
472 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 
206 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  38.71 
 
 
149 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
149 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  26.14 
 
 
209 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  41.07 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  37.1 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  37.1 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  37.1 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
382 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  37.1 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  47.17 
 
 
315 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.72 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  31.13 
 
 
200 aa  42  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08290  hypothetical protein  41.43 
 
 
210 aa  41.6  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0114182  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
200 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0361  hypothetical protein  32.86 
 
 
182 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
212 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>