193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3499 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  75.51 
 
 
197 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.74 
 
 
195 aa  187  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.88 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.21 
 
 
197 aa  167  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
194 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
194 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.69 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  42.02 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1267  putative NAD(P)H dehydrogenase (quinone) protein  41.05 
 
 
194 aa  137  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.95 
 
 
195 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3555  NAD(P)H dehydrogenase protein  38.46 
 
 
193 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1673  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.27 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000846124  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4668  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 
193 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  40 
 
 
211 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1100  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.44 
 
 
195 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242851  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1476  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.36 
 
 
193 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2033  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 
195 aa  124  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.53 
 
 
209 aa  121  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.9 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.79 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.74 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.8 
 
 
191 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.99 
 
 
191 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.49 
 
 
191 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.97 
 
 
191 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  35.19 
 
 
191 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.97 
 
 
191 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.97 
 
 
191 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 
191 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.97 
 
 
191 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  38.57 
 
 
198 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0727  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  31.38 
 
 
198 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33 
 
 
198 aa  99  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.15 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.5 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 
200 aa  92.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
198 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0713  hypothetical protein  35.4 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.97 
 
 
204 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  29.8 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.9 
 
 
193 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.84 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.9 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.9 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.13 
 
 
198 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.9 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.9 
 
 
193 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.51 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.5 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.9 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.9 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  30.18 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0238  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  24.5 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000322122  hitchhiker  0.00000000773634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.87 
 
 
230 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.16 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.57 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.76 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4553  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 
218 aa  84.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.69 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.93 
 
 
249 aa  84  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.67 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.335878 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  27.69 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  30.43 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.19 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  29.9 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  39.02 
 
 
259 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.38 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.25 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.71 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0837  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3301  hypothetical protein  28.36 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  28.8 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154354  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.9 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  39.02 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0979  hypothetical protein  40.37 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.58351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00905  hypothetical protein  40.37 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.37 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.84 
 
 
262 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2695  hypothetical protein  40.37 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.59295  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.61 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00912  hypothetical protein  40.37 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.258125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2450  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.48 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  0.966087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2429  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.71 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.391574 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.44 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.4 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65760  NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.09 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299621  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3388  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.45 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5708  NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.41 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>