42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1451 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1451  peptidase M15A  100 
 
 		 433 aa  876    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556547  hitchhiker  0.00120403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  47.31 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  51.55 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  52.17 
 
 		 426 aa  179  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  52.2 
 
 		 347 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  51.57 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0028  Peptidase M15A  45.45 
 
 		 142 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0040  Peptidase M15A  39.39 
 
 		 142 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  33.86 
 
 		 182 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  33.86 
 
 		 182 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  33.86 
 
 		 182 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4190  protein of unknown function DUF882  36 
 
 		 256 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  35.58 
 
 		 234 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  35.05 
 
 		 124 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  35.05 
 
 		 124 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5363  hypothetical protein  26.63 
 
 		 234 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0595161 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  32.67 
 
 		 183 aa  46.6  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  32.93 
 
 		 182 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  32.93 
 
 		 182 aa  46.6  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  32.93 
 
 		 182 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  29.27 
 
 		 182 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  32.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  32.67 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  32.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  32.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  32.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  45.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  36.36 
 
 		 194 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  30.83 
 
 		 190 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  28.33 
 
 		 187 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  33.33 
 
 		 182 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  34.02 
 
 		 124 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  28.06 
 
 		 184 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>